Частоты остатков в протеомах Escherichia coli (strain K12) и Vulcanisaeta moutnovskia (strain 768-28)
Как мы видим из таблицы 2, в три самых редких входят одинаковые остатки (не считая селеноцистеина), а из самых частых совпадает только первый (лейцин). Самая большая по абсолютной величине разница наблюдается для изолейцина (в архее его больше на 3.1%).
Таблица 1. Информация о протеомах
| Параметр | Vulcanisaeta | Escherichia |
|---|---|---|
| Proteome ID | UP000007485 | UP000000625 |
| Кол-во последовательностей | 2,318 | 4,306 |
| Кол-во остатков | 2,298,983 | 4,641,652 |
Таблица 2. Частоты остатков в протеомах
| Остаток | Vulcanisaeta (%) | Escherichia (%) | Δ |
|---|---|---|---|
| L | 10.5 | 10.7 | -0.2 |
| I | 9.1 | 6.0 | 3.1 |
| V | 8.4 | 7.1 | 1.3 |
| G | 7.2 | 7.4 | -0.1 |
| A | 6.8 | 9.5 | -2.7 |
| S | 6.2 | 5.8 | 0.4 |
| R | 6.0 | 5.5 | 0.5 |
| E | 5.9 | 5.8 | 0.2 |
| T | 5.1 | 5.4 | -0.3 |
| K | 4.9 | 4.4 | 0.5 |
| D | 4.8 | 5.2 | -0.3 |
| N | 4.6 | 4.0 | 0.6 |
| Y | 4.5 | 2.9 | 1.7 |
| P | 4.4 | 4.4 | 0.0 |
| F | 3.5 | 3.9 | -0.4 |
| M | 2.7 | 2.8 | -0.1 |
| Q | 1.9 | 4.4 | -2.6 |
| H | 1.5 | 2.3 | -0.8 |
| W | 1.3 | 1.5 | -0.3 |
| C | 0.7 | 1.2 | -0.5 |
| U | 0.0 | 0.0 | 0.0 |