Чтение последовательностей по Сэнгеру.
Характеристика хроматограммы в целом
- Длины начального и конечного нечитаемых участков: прямая 65 и 80 np, обратная 37 и 90 np
- Шум в среднем составляет примерно 10% от сигнала в прямой последовательности, и 7% в обратной
- Уровень шума увеличивается ближе к краям последовательности, а то время как уровень сигнала колеблется вдоль всей последовательности (в обеих последовательностях)
Обоснование решений для четырех проблемных нуклеотидов или полиморфизмов:
Прямая цепь | Обратная цепь | Решение и обоснование |
N → c: уровень сигнала тимина чуть больше среднего уровня шума, и в обратной последовательности цитозин. | ||
N → a: уровень сигнала гуанина чуть больше среднего уровня шума, и в обратной последовательности аденин. | ||
N → a: уровень сигнала гуанина чуть больше среднего уровня шума, и в обратной последовательности аденин. | ||
N → y: уровень сигнала тимина намного больше среднего уровня шума, в обратной последовательности данный участок нечитаем. |
Всего было найдено три проблемных нуклеотида в прямой последовательности и 6 в обратной.