Зачетное задание 3
 

Эволюционная модель

В последователтность гена PdxJ были внесены были внесены мутации с помошью программы msbar пакета emboss, в соответствии с деревом эволюции изображенным на рисунке.
 
Модель эволюции гена PdxJ. Расстояния приведены в числе мутаций на 100 нуклеотидов.

Скрипт, поданный в программу msbar:

 

msbar p24223.embl mut_a1.embl -point 4 -count 73 -auto
msbar mut_a1.embl mut_a2.embl -point 4 -count 73 -auto
msbar mut_a1.embl mut_с.embl -point 4 -count 658 -auto
msbar mut_a2.embl mut_a.embl -point 4 -count 585 -auto
msbar mut_a2.embl mut_b.embl -point 4 -count 585 -auto
msbar p24223.embl mut_b1.embl -point 4 -count 439 -auto
msbar mut_b1.embl mut_b2.embl -point 4 -count 37 -auto
msbar mut_b2.embl mut_e.embl -point 4 -count 219 -auto
msbar mut_b2.embl mut_f.embl -point 4 -count 219 -auto
msbar mut_b1.embl mut_d.embl -point 4 -count 256 -auto

 
 

Анализ модели:
Определение эволюционного расстояния между нуклеотидными последовательностями
Сравнение методов реконструкции деревьев 

 

 

Третий сесместр

Главная страница