Учебный сайт Аксеновой Марины
Главная
Обучение
I семестр
II семестр
III семестр
IV семестр
VII семестр
Публикации
О себе
Ссылки
Контакты
I семестр
Архея Acidilobus saccharovorans 345-15
Белок Elongation factor 1-alpha археи Acidilobus saccharovorans 345-15
Вирус Reptile bornavirus 1 strain 251327
Сравнение геномов вируса, археи и млекопитающего
Работы блока "Excel"
II семестр
Визуализация молекул
Внутренности белков и макромолекулярных комплексов
Водородные связи. Подвижность белка
Белок Elongation factor 1-alpha. Информация из различных БД
Белки, содержащие пирролизин
Выравнивание и гомология
Предсказание парных выравниваний
BLAST
PSI-BLAST. Множественное выравнивание
Семейства белковых доменов
III семестр
Химическое строение нуклеиновых кислот. ChemSketch
A- и В- формы ДНК. Структура РНК
Комплексы ДНК-белок
Прочтение последовательностей по Сэнгеру
Нуклеотидные банки данных
Поиск по сходству (blast)
EMBOSS
Выравнивание геномов
Гены прокариот
Гены эукариот
Ресеквенирование. Поиск полиморфизмов у человека
Сборка de novo
IV семестр
Филогенетические деревья. Таксономия выбранных бактерий
Укоренение в среднюю точку
Построение дерева по нуклеотидным последовательностям
Ферменты и метаболические пути
Геномное окружение. Онтология GO
Мембранные белки
Поиск сигналов. Теория
Поиск сигналов. Chip-seq
Работы блока "Эволюционные домены"
VII семестр
Восстановление "экспериментальной" электронной плотности
Кристалл из белков
Восстановление структуры по "экспериментальным данным РСА" в одномерной модели
Поиск по PDB и содержание PDB файла
Сравнение ЯМР- и РСА-структур одного белка
Вторичная структура
Файл структурных факторов
Совмещение структур
Гидрофобные кластеры
Отчет по качеству РСА расшифровки структуры "своего" белка
Практикум 1. Визуализация молекул
Практикум 2. Внутренности белков и макромолекулярных комплексов
Практикум 3. Водородные связи между белком и ДНК. Белок в движении
Практикум 5. Базы последовательностей белков
Практикум 6. Поиск в базах данных
Практикум 8. Выравнивание и гомология
Практикум 9. Предсказание парных выравниваний
Практикум 11. BLAST
Практикум 12. PSI-BLAST. Множественное выравнивание
Практикум 13. Семейства белковых доменов