Дисульфид оксиредуктаза (DISULFIDE OXIDOREDUCTASE)

Краткое название белка — DSBA_ECOLI

Полное название организма — Escherichia coli , K-12

Название гена — dsbA

Номер локуса в бактериальной хромосоме — b3859

Последовательность в формате FASTA


>DSBa_ECOLI
  MKKIWLALAGLVLAFSASAAQYEDGKQYTTLEKPVAGAPQVLEFFSFFCPHC
  YQFEEVLHISDNVKKKLPEGVKMTKYHVNFMGGDLGKDLTQAWAVAMALGVE
  DKVTVPLFEGVQKTQTIRSASDIRDVFINAGIKGEEYDAAWNSFVVKSLVAQ
  QEKAAADVQLRGVPAMFVNGKYQLNPQGMDTSNMDVFVQQYADTVKYLSEKK

Мои вычисления с помощью Excel

Aминокислотный состав белка

A Аланин	10.6%
D Аспарагиновая к-та	5.8%
E Глутаминовая к-та	5.8%
H Гистидин	1.4%
C Цистеин	1%
K Лизин	9.1%
N Аспарагин	3.4%
G Глицин	6.7%
Q Глутамин	6.7%
F Фенилаланин	5.8%
I Изолейцин	2.9%
R Аргинин	1.4%
L Лейцин	7.7%
M Метионин	3.4%
P Пролин	3.4%
S Серин	4.8%
T Треонин	4.3%
W Триптофан	1.4%
Y Тирозин	3.8%
V Валин	10.6%

Длина последовательности —208 а.о.

Молярная масса —23107,62 г/моль

Средний заряд молекулы при pH=7.0 — -2.87, рН=1.0 — 24,76

Отношение содержания гидрофильных остатков к гидрофобным —1,0875. Преобладание гидрофобных остатков нал гидрофильными незначительно и близко к среднему для E.coli. Учитывая это, а также то, что белок сравнительно небольшой, его нельзя считать мембранным.

гидрофобные

аланин
валин
изолейцин
лейцин
метионин
фенилаланин
цистеин

гидрофильные

аргинин
аспарагин
аспарагиновая кислота
гистидин
глутамин
глутаминовая кислота
лизин
серин