На главную страницу второго семестра

На главную

Мотивы в белке DSBA_ECOLI, описанные в БД Prosite

Идентификатор документа PROSITE (AC) Название мотива Краткое описание мотива Тип подписи (паттерн, профиль) Паттерн (регулярное выражение) Специфична ли подпись? Сколько мотивов нашлось в белке?
PS00194 THIOREDOXIN активный сайт семейства тиоредоксина паттерн [LIVMF] - [LIVMSTA] - x - [LIVMFYC] - [FYWSTHE] - x(2) - [FYWGTN] - C - [GATPLVE] - [PHYWSTA] - C - {I} - x - {A} - x(3) - [LIVMFYWT] специфична 1
PS00008 MYRISTYL Сайт N-миристоилирования паттерн G - {EDRKHPFYW} - x(2) - [STAGCN] - {P} [G is the N - myristoylation site] не специфична 5
PS00006 CK2_PHOSPHO_SITE сайт фосфорилирования казеинкиназы II паттерн [ST] - x(2) - [DE] [S or T is the phosphorylation site] не специфична 3
PS00005 PKC_PHOSPHO_SITE сайт фосфорилирования протеинкиназы С паттерн [ST] - x - [RK] не специфична 3
PS00003 SULFATION сайт сульфатации тирозина правило   не специфична 1

Я провела поиск мотивов в белке DSBA_ECOLI. В результате было найдено 13 мотивов. Один из них спецефичен, другие - нет (это можно проверить два раза проведя поиск - по спецефичным и неспецефичным соответственно). Лишь один из мотивов является правилом, остальные - паттерны.


©Гайдукова Аксиния