Идентификатор документа PROSITE (AC) | Название мотива | Краткое описание мотива | Тип подписи (паттерн, профиль) | Паттерн (регулярное выражение) | Специфична ли подпись? | Сколько мотивов нашлось в белке? |
PS00194 | THIOREDOXIN | активный сайт семейства тиоредоксина | паттерн | [LIVMF] - [LIVMSTA] - x - [LIVMFYC] - [FYWSTHE] - x(2) - [FYWGTN] - C - [GATPLVE] - [PHYWSTA] - C - {I} - x - {A} - x(3) - [LIVMFYWT] | специфична | 1 |
PS00008 | MYRISTYL | Сайт N-миристоилирования | паттерн | G - {EDRKHPFYW} - x(2) - [STAGCN] - {P} [G is the N - myristoylation site] | не специфична | 5 |
PS00006 | CK2_PHOSPHO_SITE | сайт фосфорилирования казеинкиназы II | паттерн | [ST] - x(2) - [DE] [S or T is the phosphorylation site] | не специфична | 3 |
PS00005 | PKC_PHOSPHO_SITE | сайт фосфорилирования протеинкиназы С | паттерн | [ST] - x - [RK] | не специфична | 3 |
PS00003 | SULFATION | сайт сульфатации тирозина | правило | не специфична | 1 |
Я провела поиск мотивов в белке DSBA_ECOLI. В результате было найдено 13 мотивов. Один из них спецефичен, другие - нет (это можно проверить два раза проведя поиск - по спецефичным и неспецефичным соответственно). Лишь один из мотивов является правилом, остальные - паттерны.