На главную страницу второго семестра

На главную

Матрицы замен

Изучение матрицы BLOSUM62

Можно заметить, что средний вес замен внутри первой группы равен 0, внутри второй группы 0.8333. Средний вес замен между группами оказался равен -0.8125. Видно, что средний вес между группами меньше среднего веса внутри групп, что может означать, что аминокилоты из разных групп обладают различными свойствами, а аминокислоты в пределах одной группы схожи по свойствам.

Здесь можно увидеть файл Excel, в котором находятся таблицы с матрицами замен.

Вычисление весов замен аминокислот на основе одного "блока"

Веса аминокислотных замен
Пара аминокислот Вес по BLOSUM62 Вес, вычисленный по блоку
A-A 4 4.67
A-N -2 2.21
A-S 1 3.59

Все расчёты приведены в файле Excel на станицах "Частоты" и "Веса".


©Гайдукова Аксиния