Для выравнивалия были выбраны 4 первых амнокислотных остатка DSBA_ECOLI и искусственная последовательность из 5 букв, полученная следующим образом: я внесла в последовательность первых 4-х остатков моего белка две замены и в произвольном месте вставила дополнительную букву.
Здесь можно увидеть файл Excel, в котором на станице Global расположено глобальное выравнивание, а на листе Local - локальное.
Используя алгоритм Нидельмана – Вунша, я получила вес оптимального выравнивания 0. Точнее сказать, у меня получилось несколько оптимальных выравниваний с одинаковым весом.
Используя алгоритм Смита – Ватермана, я получила 3 локальных выравнивания по 2 буквы каждое.