Белок участвующий в делении клеток rRNA(уридин 2'-О-)-метилтрансфераза

Краткое название белка —RRMJ_ECOLI

Полное название организма — Escherichia coli , K-12

Название гена —pflB

Номер локуса в бактериальной хромосоме —b0903

Последовательность в формате FASTA


>RRMJ_ECOLI
MTGKKRSASSSRWLQEHFSDKYVQQAQKKGLRSRAWFKLDEIQQSDKLFKPGMTVVDLGAAPGGWSQYVVTQ
IGGKGRIIACDLLPMDPIVGVDFLQGDFRDELVMKALLERVGDSKVQVVMSDMAPNMSGTPAVDIPRAMYLV
ELALEMCRDVLAPGGSFVVKVFQGEGFDEYLREIRSLFTKVKVRKPDSSRARSREVYIVATGRKP

Мои вычисления с помощью Excel

Aминокислотный состав белка:

A	Аланин	5%
D	Аспарагиновая к-та	1%
E	Глутаминовая к-та	7%
H	Гистидин	4%
C	Цистеин	7%
K	Лизин	9%
N	Аспарагин	0%
G	Глицин	5%
Q	Глутамин	1%
F	Фенилаланин	8%
I	Изолейцин	8%
R	Аргинин	8%
L	Лейцин	8%
M	Метионин	3%
P	Пролин	11%
S	Серин	4%
T	Треонин	4%
W	Триптофан	5%
Y	Тирозин	2%
V	Валин	0%

Длина последовательности —208 а.о.

Молярная масса —23338,7 г/моль

Средний заряд молекулы при pH=7.0 — 7.041

Отношение содержания гидрофильных остатков к гидрофобным —1,0959. Преобладание гидрофобных остатков нал гидрофильными незначительно и близко к среднему для E.coli. Учитывая это, а также то, что белок сравнительно небольшой, его нельзя считать мембранным.

D 0.009 A 0.053

E 0.072 C 0.067

H 0.043 F 0.077

K 0.086 I 0.076

N 0.005 L 0.076

Q 0.014 M 0.028

R 0.081 V 0.005

S 0.038