Консервативные аминокислотные остатки в выборке 4 потенциальных ортологов белка RRMJ_ECOLI

Матрица попарного сходства

                 RRMJ_ECOLI   RRMJ_PSEAE   RRMJ_BUCAI   RRMJ_BUCBP   RRMJ_RICPR

  RRMJ_ECOLI        100%

  RRMJ_PSEAE         56%         100%

  RRMJ_BUCAI         51%          43%         100%

  RRMJ_BUCBP         52%          42%          50%          100%

  RRMJ_RICPR         39%          37%          32%          31%          100%

Множественное выравнивание

Цвета, отвечающие степени консервативности колонок:

красный — 100% идентичности
голубой — более 80% идентичности

Консервативность участков белка RRMJ_ECOLI, взаимодействующих с лигандом

Изображение 3D-структуры белка RRMJ_ECOLI

Черным цветом выделены аминокислотные остатки со 100%-ной консервативностью. Синим цветом выделены остатки с консервативностью не менее 80%.

Степень консервативности аминокислотных остатков белка RRMJ_ECOLI, находящихся на расстоянии 5 ангстрем от лиганда (определена по вышеуказанному множественному выравниванию):

Trp36, Ala60, Ala61, Pro62, Gly63, Gly64, Trp65, Leu85, Gly98, Arg101, Asp124, Met125, Ala126, Pro127, Lys164 —неконсервативны

Ser33, Gly59, Leu84, Asp99, Phe100, Leu143 — более 80% консервативности

Ala35, Cys82, Asp83 — 100% консервативности