На главную страницу второго семестра
У белка RRMJ_ecoli всего один домен:
|
 идентификатор PDB 1eiz |
RRMJ_ECOLI является достаточно консервативным белком теплового шока, встречающимся у прокариот, архей и эукариот. RRMJ_ECOLI ответственен за формилирование 23 S рРНК в позиции U2552 в аминоацил(А)1-сайте рибосомы PUBMED:11976298. Было показано, что U2552, который является одним из пяти высококонсервативных остатков, входящих в A-петлю, подвержен метилированию по 2'-OH группе рибозы у большинства известных организмов. Это говорит о том, что эта модификация играет важную роль в функционировании A-петли. Для RRMJ_ECOLI мишенью является метилированный остаток, который он узнает только, когда 23 s рРНК входит в 50 s рибосомальную субъединицу. Это говорит о том, что RRMJ_ECOLI-опосредованное метилирование должно происходить позже в процессе созревании рибосомы. Все известные до этого модификации 23 s рРНК происходят на более ранних этапах образования рибосомы.
Кристаллографическая структура, сделанная с разрешением 1,5 А, белка RRMJ_ECOLI с его кофактором S-аденозилметионином показала то, что структура RrmJ напоминает структуру метилтрансферазы. Оказалось, что активный сайт RRMJ_ECOLI формируется из трех каталитически активных остатков, двумя из которых являются остатки лизина, а один - отрицательно заряженный остаток аспартата. Другой высоко консервативный остаток (глутамат), который также расположен внутри активного центра RRMJ_ECOLI, по-видимому, не играет значительной роли в реакции переноса метильной группы in vivo PUBMED:10983982.
|
|