Практикум #12 KEGG

Мой референсный путь:

Рис 1. Референсный путь
Ниже на картинкке отмечена выбранная реакция

Рис 2. Выбранная реакция
Реакция заключается в отщиплении Поли(1,4-Альфа-D-галактуронат) галактуроногидролазой путем гидролиза, при этом отщипляется молекула D-галактуроната (при этом написано, что разрыв может быть случайным и тогда получаются два полисоединения меньшей длины, чем исходное) от Поли(1,4-Альфа-D-галактуронат).

Рис 3. Формула реакции
Номер выбранного фермента: 3.2.1.15. Код первого уровня - 3, значит этот фермент относится к гидролазам. Код второго уровня - 2, это говорит нам об основных видах субстратов, участвующих в этой реакции, здесь это говорит нам, что фермент глюкозилаза. Код третьего уровня - 1, это говорит нам более точно о том, какая связь именно является целью этой реакции (или несколько связей, плюс может упоминаться природа химических соединений, доноров или акцепторов). В данном случае это нам говорит о том, что наш фермент гликозидаза, т. е. фермент, гидролизующий О- и S-гликозильные соединения. Код четвертого уровня просто означает его порядковый номер среди всех схожих ферментов (здесь 15).
Рис 4. Метаболический путь свиньи (Sus scrofa)

Рис 5. Метаболический путь трипаносомы (Trypanosoma brucei brucei)
При поиске по организму (Sus scrofa), выдало KEGG GENOME T01009. Всего для этого организма есть 333 KEGG PATHWAY (метаболических пути). Генов, кодирующих белки 20666, а кодирующих РНК 342, всего 21008 генов