Отчет о работе с RasMol, Контакты в структуре белка

Задание 1.1

рис.1

На картинке показаны гидрфобные взаимодействия в окрестности атома PHE60.
На рисунке подписаны α-атомы а.о.
Раскраска сделана по элементам.

Задание 1.2

рис.2

рис.3

водородные связи между атомами N и О приведены на рисунках 2 и 3. Длина связи отмечена.
Задание 1.3

рис.4

Показаны дисульфидные мостики инсулина (PDBID 1zni).

Задание 2.1

Имя атома контакта	Имя контактирующего атома белка	Расстояние в Ангстремах	Предположительная природа контакта
О 4126 (О атом молекулы фосфопантеина)	N 4156 Val 40	3.39	водородная связь
О7 4130 (О7 атом молекулы фосфопантеина)	NZ 4080 LYS 29	2.61	водородная связь
N 4124 (N атом молекулы фосфопантеина)	C 4117 ASP 35	1.33	пептидная?? связь?
С 4125 (C атом молекулы фосфопантеина)	N 4133 LEU 37	1.33	пептидная?? связь?

Данная таблица отражает возможные взаимодействия и связи, удерживающие лиганд в белке.
Задание 2.2

рис.5

Изображение выбранного лиганда и атомов белка на расстоянии менее 3.5 Ангстрем (в результате предварительного исследования мы проверили, что гидрофобных взаимодействий нет).
Показана одна из водородных связей.

файл скрипта:

скрипт