Представленный ниже список хромосом дрожжей Saccharomyces cerevisiae был получен с помощью поисковой системы SRS. Был произведен поиск отдельных молекул ДНК дрожжей по банку RefSeq(DNA).
REFSEQ_DNANC_001133 NC_001133 Saccharomyces cerevisiae S288c chromosome I, complete sequence. 230218 REFSEQ_DNANC_001134 NC_001134 Saccharomyces cerevisiae S288c chromosome II, complete sequence. 813184 REFSEQ_DNANC_001135 NC_001135 Saccharomyces cerevisiae S288c chromosome III, complete sequence. 316620 REFSEQ_DNANC_001136 NC_001136 Saccharomyces cerevisiae S288c chromosome IV, complete sequence. 1531933 REFSEQ_DNANC_001137 NC_001137 Saccharomyces cerevisiae S288c chromosome V, complete sequence. 576874 REFSEQ_DNANC_001138 NC_001138 Saccharomyces cerevisiae S288c chromosome VI, complete sequence. 270161 REFSEQ_DNANC_001139 NC_001139 Saccharomyces cerevisiae S288c chromosome VII, complete sequence. 1090940 REFSEQ_DNANC_001140 NC_001140 Saccharomyces cerevisiae S288c chromosome VIII, complete sequence. 562643 REFSEQ_DNANC_001141 NC_001141 Saccharomyces cerevisiae S288c chromosome IX, complete sequence. 439888 REFSEQ_DNANC_001142 NC_001142 Saccharomyces cerevisiae S288c chromosome X, complete sequence. 745751 REFSEQ_DNANC_001143 NC_001143 Saccharomyces cerevisiae S288c chromosome XI, complete sequence. 666816 REFSEQ_DNANC_001144 NC_001144 Saccharomyces cerevisiae S288c chromosome XII, complete sequence. 1078177 REFSEQ_DNANC_001145 NC_001145 Saccharomyces cerevisiae S288c chromosome XIII, complete sequence. 924431 REFSEQ_DNANC_001146 NC_001146 Saccharomyces cerevisiae S288c chromosome XIV, complete sequence. 784333 REFSEQ_DNANC_001147 NC_001147 Saccharomyces cerevisiae S288c chromosome XV, complete sequence. 1091291 REFSEQ_DNANC_001148 NC_001148 Saccharomyces cerevisiae S288c chromosome XVI, complete sequence. 948066
Длина: 1091291
Количество генов: 569
Количество тРНК: 20
Находится на прямой цепи и не имеет интронов:
gene="PHM7" CDS: 162356..165331
Находится на прямой цепи и имеет хотя бы один интрон:
gene="RPS7A" CDS: join(505794..505937,506339..506767)
Находится на обратной цепи и не имеет интронов:
gene="MCH4" CDS: complement(94856..96361)
Находится на обратной цепи и имеет хотя бы один интрон:
gene="RPL18A" CDS: complement(join(93395..93843,94291..94402))
Для определения последовательности, кодирующей белок YOAJ_BACSU на kodomo была набрана команда entret sw:yoaj_bacsu. В полученном файле было две строки, начинающиеся с "DR EMBL".
DR EMBL; AF027868; AAB84448.1; -; Genomic_DNA.
DR EMBL; AL009126; CAB13755.1; -; Genomic_DNA.
Для определения последовательности использовался идентификатор AF027868. Границы кодирующего участка ("CDS") были определены через SRS: complement(12919..13617). Далее с помощью команд на kodomo:
seqret -sask Read and write (return) sequences Input (gapped) sequence(s): af027868.entret Begin at position [start]: 12919 End at position [end]: 13617 Reverse strand [N]: YПолученный файл af027868.fasta сохранен в директории H:\term3\block3\credits.