Метаболические пути
Холин/этаноламин киназа человека с идентификатором Swiss-Prot Q9Y259 имеет в базе данных KEGG идентификатор hsa:1120. Согласно KEGG она участвует в двух метаболических путях. Второй путь, Metabolic pathways, является обобщением всех внесенных в базу метаболических путей. Поэтому можно сказать, что холин/этаноламин киназа участвует в одном пути.
| Идентификатор KEGG | Название (eng) | Название (рус) |
| hsa00564 | Glycerophospholipid metabolism | Метаболизм глицерофосфолипидов |
| hsa01100 | Metabolic pathways | Метаболические пути |
Рисунок 1. Карта пути hsa00564 (метаболизм глицерофосфолипидов). Для увеличения изображения нажмите на картинку.
Сколько ферментов человека с близкими функциями описано в Swiss-Prot?
Для определения количества ферментов у человека был использован поиск по SRS.
Структурные формулы соединений
В базе KEGG LIGAND (KEGG COMPOUND) была найдена информация о L-треонине и L-изолейцине.
| Название (рус) | Название (eng) | Идентификатор | Структурная формула |
| L-Треонин | L-Threonine; 2-Amino-3-hydroxybutyric acid | C00188 |  |
| L-Изолейцин | L-Isoleucine; 2-Amino-3-methylvaleric acid | C00407 |  |
Поиск метаболического пути, соединяющего L-треонин и L-изолейцин
В KEGG PATHWAY было найдено два пути, в которых соединены L-треонин и L-изолейцин: ko01230 Biosynthesis of amino acids и ko00290 Valine, leucine and isoleucine biosynthesis. Первый путь включает в себя второй. Поэтому можно учверждать, что эти аминокислоты соединены в одном пути. Направление реакций от треонина к изолейцину.
Выбранная цепочка ферментативных реакций
Карта: биосинтез валина, лейцина и изолейцина
Путь: треонин > изолейцин
Рисунок 2. Карта пути ko00290 биосинтез валина, лейцина и изолейцина. Начальное вещество выделено красным, конечное – зеленым, а промежуточные - желтым. Для увеличения изображения нажмите на картинку.
Скромное мнение студента о базе данных KEGG
KEGG простая по интерфейсу и прятная по оформлению база. Она построена по типу интерактивной энциклопедии, в которой собрано большое количество информации, в том числе данные об экспресии генов, метаболические пути, лиганды, лекарства и проч. База поделена на разделы по типу информации. Из одного раздела можно легко перейти в другой. Метаболические карты просты для понимания. Для участников пути легко найти идентификаторы. Дата последнего обновления 1 января 2014 года. То есть новые данные не вносились уже три месяца. Насколько это плохо? Возможно обновления производятся сразу большими проверенными объемами информации.