3D

На главную страницу первого семестра

Описание пространственной структуры : COAE_ECOLI по данным банка PDB, код 1vhl

На рисунке представлена остовная модель белка.
Цепи покрашены в разные цвета: цепь A - синяя,
цепь B - красная, а цепь C - желтая.
Кроме того на рисунке можно заметить молекулы комплекса,
которые показаны как пространственное скопление шариков-атомов.
С цепью A связан аденозино-5-дифосфат,
а с цепями B и C - ацетат-ионы.


restrict none
background white
select protein
trace 100
color chains
script H:\term1\work\1vhl.def
select C
color yellow
select B
color pink
select het
spacefill
color cpk
select ADP*.O2B
label ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE
color label black
set fontsize 8
set fontstroke 1
select ACT*.OXT
label ACETATE ION
select *0A.CA
label DEPHOSPHO-COA KINASE, chain A
select *147B.CA
label DEPHOSPHO-COA KINASE, chain B
select *85C.CA
label DEPHOSPHO-COA KINASE, chain C
zoom 100
echo The protein with complex
Слева находится скрипт, с помощью которого
может быть получено изображение белка,
предоставленного выше.
Данный скрипт, вставленный в командную строку RasWin'а
оставляет только остовную модель белка, раскрашивает цепи,
выделяет молекулы комплекса, как шарики и делает подписи
ко всем основным объектам.


©Куликовский, Алексей