 |
Рис.1 На рисунке в толстой проволочной модели изображена молекула АДФ. В более тонкой прволочной модели вокруг АДФ изображены контактирующие с ней аминокислоты, причем их углеродные остовы покрашены в зеленый цвет (для удобства), а в виде синих и красных шариков изображены молекулы азота и кислорода соответственно. |
 |
Рис.2 Здесь изображено гидрофобное взаимодействие белка с АДФ. Молекула АДФ — в центре в проволочной модели. Зеленым выделены аминокислоты, гидрофобно взаимодействующие с лигандом. Желтыми шариками показаны атомы, вступающие в гидрофобное взаимодействие. |
 |
Рис.3 На рисунке представлено взаимодействие аминокислот белка (фиолетовый цвет) с молекулой АДФ (прволочная модель в центре) через "водяные мостики". Молекулы воды показаны как красные шарики. |
 |
Рис.4 Данное изображение демонстрирует гидрофильные связи белка с молекулой АДФ. Углеродный остов АДФ для удобства выделен зеленым цветом. Атомы аминокислот, гидрофильно взаимодействующие с лигандом представлены крупными шариками. Красные атомы — атомы кислорода, синие — азота, серые атомы — углерода (в аминокислотах) и оранжевые атомы — атомы фосфора. |