prosite_motives

На главную страницу второго семестра

Мотивы в белке дефосфо-CoA-киназа, описанные в БД Prosite

Идентификатор документа PROSITE (AC) Название мотива Краткое описание мотива Тип подписи (паттерн, профиль) Паттерн (регулярное выражение) Специфична ли подпись? Сколько мотивов нашлось в белке?
PS01294 COAE Dephospho-CoA kinase signature паттерн [GN]-x-[LIVFM]-x-R-x(2)-[LIM]-[GSAR]-x(3)-[FY]-x(8)-[LV]-x(5)-P-x-[LIVM] специфична 1
PS00008 MYRISTYL N-myristoylation site паттерн G-{EDRKHPFYW}-x(2)-[STAGCN]-{P} неспецифична 4
PS00017 ATP_GTP_A ATP/GTP-binding site motif A (P-loop) паттерн [AG]-x(4)-G-K-[ST] неспецифична 1
PS00005 PKC_PHOSPHO_SITE Protein kinase C phosphorylation site паттерн [ST]-x-[RK] неспецифична 1

Таким образом специфичным оказался лишь один мотив. Это вполне правильно, учитывая, что в данном семействе белков дефосфо-CoA-киназ функциональную роль играет только один домен. Поэтому же этот мотив имеет и самые большие размеры, по сравнению с остальными неспецифическими.


©Куликовский, Алексей