Характеристика паттерна | Паттерн | В скольких последовательностях банка Swiss-Prot найден мотив, удовлетворяющий паттерну? | Все ли последовательности из Вашего выравнивания найдены? |
Фрагмент последовательности | S-D-G-V-T-E-D-N-V-L-R-M-M-S | 1 | да |
Сильный | [TS]-D-[NG]-V-T-[ELI]-[DE]-[NG]-V-[IL]-[QRD]-[LM]-[ML]-[SVA] | 8 | да |
Слабый | [NG]-[VI]-T-X-[DE]-[NG]-V-[LIMV]-[QRD]-[ILMV] | 9 | да |
2. Все описанные в PROSITE мотивы в заданном белке XXXX_BACSU
Идентификатор документа PROSITE (AC) | Название мотива | Краткое описание мотива | Тип подписи (паттерн, профиль) | Паттерн (регулярное выражение) | Специфична ли подпись? | Сколько мотивов нашлось в белке? |
PS00006 | CK2_PHOSPHO_SITE | Casein kinase II phosphorylation site | паттерн | [ST] - x(2) - [DE] [S or T is the phosphorylation site] | неспецифична | 4 |
PS00008 | MYRISTYL | N-myristoylation site | паттерн | [ST] - x(2) - [DE] [S or T is the phosphorylation site] | неспецифична | 2 |
PS00005 | PKC_PHOSPHO_SITE | Protein kinase C phosphorylation sitу | паттерн | [ST] - x(2) - [DE] [S or T is the phosphorylation site] | неспецифична | 1 |