Работа с Pymol
Зона контакта лиганда с белком:
Пунктиром показаны водородные связи с белком
На данном рисунке показаны контакты лиганда с белком с мутациями - я заменила Asn46 и Asp52 на Gly.
Метка TAMRA прикреплена к белку через сложноэфирную связь с -OH группой Ser81.
Скрипт для создания спирали из 100 аланинов.
© Шерстюк Александра, MSU 2012