В рамках этого практикума был сформирован запрос на сервес RSCB PDB, где хранятся структуры биомакромолекул.
Лучшей находкой оказалась запись с идентификатором 3VM4. Дата публикации записи — 9 мая 2012 года, что соответствует условию. Детали разлчимы на расстоянии 1.94 Å. Белок с данным идентификатором - это цитохром P450SP α в комплексе с (R)-ибупрофеном (искомое ключевое слово). В составе имеет 3 лиганда. Цитохром является ферментом, ускоряющим эпоксидирование (превращение двойной связи в эпоксидное кольцо) стирола. Ибупрофен выполняет роль кислотно-основного катализатора этой реакции, причём в присутствии (R)-ибупрофена образуется (S)-оксид стирола. Запись была визуализирована в трёх различных вариантах.
Ноутбук с практикумом