Частоты остатков в протеомах Escherichia coli (штамма K12) и бактерии Bradyrhizobium sp. CCGE-LA001.
Идентификаторы протеомов
| Общая информация |
| Характеристика |
Bradyrhizobium sp. CCGE-LA001 |
Escherichia coli (strain K12) |
| Organism ID |
1223566 |
83333 |
| Proteome ID |
UP000019052 |
UP000000625 |
| Число последовательностей |
6907 |
4306 |
| Число остатков |
2153446 |
1356195 |
Cравнитльная таблица
| Остаток |
Escherichia(%) |
Bradyrhizobium(%) |
Разница(%) |
| A |
9,5140 |
12,4235 |
2,9095 |
| L |
10,6724 |
9,9437 |
0,7287 |
| G |
7,3746 |
8,3006 |
0,9260 |
| V |
7,0729 |
7,4503 |
0,3774 |
| R |
5,5110 |
6,9349 |
1,4239 |
| S |
5,8023 |
5,6456 |
0,1567 |
| D |
5,1513 |
5,4963 |
0,3450 |
| E |
5,7622 |
5,3886 |
0,3736 |
| I |
6,0102 |
5,3644 |
0,6458 |
| T |
5,3986 |
5,3588 |
0,0399 |
| P |
4,4264 |
5,1921 |
0,7657 |
| F |
3,8915 |
3,7829 |
0,1086 |
| K |
4,4062 |
3,7553 |
0,6509 |
| Q |
4,4398 |
3,2023 |
1,2375 |
| N |
3,9453 |
2,7718 |
1,1735 |
| M |
2,8200 |
2,4706 |
0,3494 |
| Y |
2,8452 |
2,2938 |
0,5514 |
| H |
2,2667 |
2,0250 |
0,2417 |
| W |
1,5311 |
1,3255 |
0,2057 |
| C |
1,1581 |
0,8742 |
0,2839 |
| U |
0,0002 |
0,0000 |
0,0002 |
Анализ
Анализируя Таблицу 2, мы можем сделать следующие выводы:
- Три самых частых остатка A(Аланин), L(Лейцин) и G(Глицин).
Для Bradyrhizobium sp. самым частым является Аланин, вторым по частоте Лейцин, а третьим - Глицин.
Но для Escherichia coli (strain K12) на первом месте Лейцин, затем Аланин, на третьем месте также Глицин.
- Два самых редких остатка, C(Цистеин) и W(Триптофан), совпадают для обоих протеомов.
|
