Краткое описание генома вируса < Akabane virus >

Akabane virus - это вирус, распространяемый насекомыми, вызывает врожденные аномалии центральной нервной системы у жвачных животных.[1]

Акабане вирус назван в честь района в Японии, где он был впервые найден.[1]

Клинические признаки:

Инкубационный период в естественных условиях не установлен, при экспериментальном заражении стельных коров вирус обнаруживают в тканях плода на 18-й день после инфицирования. Симптомы болезни проявляются главным образом у стельных коров в виде абортов, преждевременных отелов, рождения мертвых плодов, уродств молодняка. У новорожденных телят отмечают водянку головного мозга, артрогриппоз, желтуху, иногда слепоту, отсутствие функции сосания и паралич языка. У нестельных коров болезнь протекает в латентной форме, лишь в некоторых случаях обнаруживают кератоконъюнктивит. [2]

Таблица 1 Основные характеристики Akabane virus

Параметр	Значение
Английское название вируса	Akabane virus
Русское название вируса	Вирус Акабане
Количество фрагментов в полном геноме	3
Общая длина генома (п.н.)	12035
Количество кодируемых в геноме полипептидов	4
Количество "зрелых" вирусных белков	4

>YP_001497160.1 M polyprotein
MIITILNVLTLVVTVTAMPPRNTNGGRCFYGGDMFRQINSTSPM
SEICVRDDISLVKSIGYHKLAANREVIESSMSYYRLYYVKNWFECNPVQDILGTFMVF
DVNHEGILAPKTYACRATCSISLERDTGNVVLESPALNHYTIHGTTIKNGWFKTKVSI
DLDNTCEDLHITCGHKTLNVHACFRQHKSCIRYFKGSILPEVMIESICTNAELILLCC
FSAISCFVAIILTKTYLVYLLIPIFYPFVKLYGLLLQRFCKQCKNCLLPIHPFSPCPT
TCICGMVYNSTEALKVHRKCLNCTGYKTLTKTRYLCKKRLPNMVLATISTVLFFTFIT
PITAECYNYTSLPADFQAAIDKNNSCTREQLIMIILTILCIASTIMVISAVHLYIRIY
YVFCAYCGMVHEKKGLILLDNFTSHCLTCICRDKSIHRANNNCVTPMKYKTAKYTNLL
CIILLIIIAVTPAFSACIQEKEIETIDDAAMCIGLYQNITQPKEYNTFVKELSSTLSS
HEIEFLLPAVKPSFDYLITKSSTSKDLHSATIHEFIAANLYPNNFKKHLASAGPGSIQ
WRTYIQNNNLHLCNDHVVKMICRCVIKQEECSSTKVDDGEQIAQYYKRNKEFYKADLE
ILYTVISRAIPGLVGNLLRQVLKSQKYGESLHVLNKIKKDVSKNNQLNGIVEFLIHIN
SQNITEEVRELRIRPDLSIRGSKFTDKNPGIPDIKECQTPLFITCTGKRFRSLMKQYI
ACSNGGVKLYQRPNKPLALVGNKLCIGDKYCMIAFDPMVIDENIQKLDCYSLAATDQS
DGMLKPERSIRLLKTGECKIAGALSRIAVSINQKNYKYSTIVHKKSGLVDEYCLSPNC
DLDCYPYYPANLVDCSWSESTHSTLNQKVISHTDIESFISSVKLSLHNDLIQHHFRPL
SNMPHVKPNFKSINVQGTISGGKIQDSYITFSIPLMTGLSQGFTLQDHKGNTLFDIIA
YVKSARVIATYNHEYKTGPTVSINVQHNEQCTGSCPSSIPKKDNWLTFSREHTSTWGC
EEWGCLAIGTGCVYGSCQDVIREEATVISRVNNEQLEVEFCVSEPTSTMCNTINVLEP
VLGEHMQFEVHSVQTNLLPEVALIKNRRVYKGSINKKGVFNPQCGSVQSFDGKLYGIG
NPKFDYICHALSRKDIVVRKCYENHYYSCATLKEAVEIKPNITNSKTMLYNDNALLGS
ASVKIMLGDLIYQQTSVQEKDIRGHATCGGCTDCFNDVACKISMTSNGVYQCPIVSSC
DSYINNVYINEGTNDVNLKFRCLKAEIKISICGKEIPVKSEIIKDTKKLDWASADQTS
YIKEFDKKCATWLCRAYNEGIGFVLEPLWNELSLWGKYVLLALAIIISVLILVKVIRP
LARYVVAVLKENDKVYKLENKLK

Список литературы:

[1] https://en.wikipedia.org/wiki/Akabane_virus

[2] http://diseasecattle.ru/bolezni-vyzyvaemye-virusami/bolezn-akabane.html