Параметры водородных связей между остовными атомами во вторичной структуре
# Имена Атомов Длина связи (Å) Угол N-H-O (°)
Альфа-спирали
1 [ASP]325:A.N - [LYS]321:A.O 2.93 160.20
2 [LEU]318:A.O - [ALA]322:A.N 2.89 161.2
3 [GLY]83:A.N - [GLN]79:A.O 2.91 138.78
Бета-тяжи
1 [MSE]237:A.N - [GLY]145:A.O 2.88 169.34
2 [ARG]170:A.O - [ASP]209:A.N 2.90 131.79
3 [VAL]142:A.N - [GLY]239:A.O 2.93 (Å) 159.67

В таблице представлены данные о водородных связях, полученные при помощи Jmol — программы для просмотра структуры молекул в трёх измерениях. Получены значения для белка 4PBH. Измерения показывают, что расстояние между водородными связями принимают значения от 2.8 (Å) до 3.2 (Å), угол лежит в диапазоне 130° - 170°. Максимальное значение длины водородных связей в белках — 3,5 ангстрем, что вполне сходится с полученными данными. Водородная связь достигает максимальной силы при угле N—Н—O 180°, но из-за влияния боковых цепей аминокислот средний угол составляет около 155°. Вывод: значения сходится с теоретическими данными.

Литература:
1) Основы биохимии Ленинджера: в 3т. Т.1: Строение и катализ / Д. Нельсон, М. Кокс

2) https://www.britannica.com/science/hydrogen-bonding

3) https://www.rcsb.org/structure/4PBH