В данной таблице приведены данные о парном глобальном и о парном локальном выравнии гомологичных и негомологичных пар белков. Сравнив результаты, видно, что гомологичные пары отличаются от негомологичных большим количеством очков (score), более высокими процентом одинаковых и схожих аминокислот. Так же видно, что в глобальном выравнивании количество пропусков у гомологичных пар много меньше, в локальном выравнивании такой большой разницы не наблюдается, однако в локальном выравнивании негомологичных белков, хотя бы у одного из белков процент покрытия сильно ниже, чем в среднем у гомологичных.
Примеры выравнивания syp_mycge и syp_clobj. Сначала множественное, затем - глобальное, после - локальное.
Как можно заметить, парное выравнивание довольно похоже и мало чем отличается. Похожее мы уже видели в предыдщем пункте: глобальное и локальное выравнивание у гомологичных белков схожи. Множественное выравнивание же хоть и имеет схожести, но заметно отличается, что неудивительно из его построения.
Главная страница