Филогенетические деревья

Занятие 1

Цель занятия: поработать с филогенетическим деревом нескольких бактерий.

Выбраны следующие бактерии:

Название Мнемоника

Escherichia coli ECOLI

Salmonella typhimurium SALTY

Agrobacterium tumefaciens AGRRK

Rhizobium etli RHIEC

Vibrio cholerae VIBCH

Vibrio fischeri VIBFM

Haemophilus influenzae HAEIN

Enterobacter sp. 638 ENT38

Скобочная формула: (((VIBFM, VIBCH), (HAEIN, ((ECOLI, SALTY), ENT38))), (AGRRK, RHIEC));

Список нетривиальных ветвей:

{RHIEC, AGRRK, ENT38, SALTY, ECOLI, HAEIN} против {VIBCH, VIBFM}

{ENT38, SALTY, ECOLI, HAEIN, VIBCH, VIBFM} против {RHIEC, AGRRK}

{ENT38, SALTY, ECOLI, HAEIN} против {VIBCH, VIBFM, RHIEC, AGRRK}

{ENT38, SALTY, ECOLI } против {HAEIN, VIBCH, VIBFM, RHIEC, AGRRK}

{SALTY, ECOLI} против {RHIEC, AGRRK, ENT38, HAEIN, VIBCH, VIBFM}