Таблица 1. Информация о домене двойная GTPаза 1.
ID AC Число последовательностей в Seed Число последовательностей в Full
DO-GTPase1 PF19975 46 121

Выравнивание seed домена (табл. 1) было взято из сайта Pfam.
Ссылка: проект. Блоки разграничены линиями разных цветов (зелёный - вертикальный плюс-блок, жёлтый - частичный плюс-блок, красный - минус-блок (и вертикальный, и частичный)), раскраска по Clustalx. Паттерны составлялись на основе того, какие аминокислоты входят в блок (есть ли замены, гэпы) (табл. 2).

Таблица 2. Блоки и паттерны.
Тип блока Паттерн Координаты
Вертикальный плюс-блок (V) [IVMWLCAF][LMFIV][VLF][FML][IVLVA] 125-129
Частичный плюс-блок (P) [AV].P[LM]DWVT 141-148
Минус-блок (M) - 36-39
Пояснение: в квадратные скобки брались аминокислоты, принадлежащие к одной функциональной группе (алифатические, ароматические, гидрофильные, гидрофобные, незаряженные, заряженные (отрицательно)).