Третий практикум/title> <link href="https://cdn.jsdelivr.net/npm/bootstrap@5.3.0/dist/css/bootstrap.min.css" rel="stylesheet" integrity="sha384-9ndCyUaIbzAi2FUVXJi0CjmCapSmO7SnpJef0486qhLnuZ2cdeRhO02iuK6FUUVM" crossorigin="anonymous"> <link rel="stylesheet" type="text/css" href="../styles.css">  <script type="text/javascript" src="https://vsb.fbb.msu.ru/share/jmol/jsmol/JSmol.min.js"> </script> <script type="text/javascript">  var Info = {  serverURL: "https://chemapps.stolaf.edu/jmol/jsmol/php/jsmol.php", j2sPath: "https://vsb.fbb.msu.ru/share/jmol/jsmol/j2s/",  use: "HTML5", disableJ2SLoadMonitor: true, disableInitialConsole: true, allowJavaScript: true, console: "none", debug: false,  width: 360, height: 360, color: "#eeffff", script: "script https://kodomo.fbb.msu.ru/~alfiya.44/term2/scriptname.spt" };  $(document).ready(function(){   $("#jmol").html(Jmol.getAppletHtml("JSMol", Info));    $("#jmolStart").html(Jmol.jmolButton(JSMol, 'script http://kodomo.fbb.msu.ru/~<user>/<termX>/<prX>/<script.spt>', 'Start script'));   $("#jmolResume").html(Jmol.jmolButton(JSMol, 'resume', 'Resume')); }); </script> </head> <body> <header>  <nav class="navbar navbar-expand-lg bg-body-tertiary"> <div class="container-fluid"> <a class="navbar-brand" href="https://fbb.msu.ru/"> <img src="../img/logo_new.png" alt="FBB" width="80" height="80"> </a> <div class="collapse navbar-collapse" id="navbarSupportedContent"> <ul class="navbar-nav ms-auto mb-lg-0"> <li class="nav-item"> <a class="nav-link" href="../index.html">Главная</a> </li> <li class="nav-item"> <a class="nav-link active" aria-current="page" href="../terms.html">Семестры</a> </li> </ul> </div> </div> </nav> </header> <script src="https://cdn.jsdelivr.net/npm/bootstrap@5.3.0/dist/js/bootstrap.bundle.min.js" integrity="sha384-geWF76RCwLtnZ8qwWowPQNguL3RmwHVBC9FhGdlKrxdiJJigb/j/68SIy3Te4Bkz" crossorigin="anonymous"></script> <div class="container"> <div class="row"> <div class="col-4"> <div class="jmol_app"> <h3>Визуализация белка 7KR0 в Jmol:</h3> <table border = 2pt> <tr> <td id='jmol'> </td> </tr> </table> <div id='jmolStart'></div> <div id='jmolResume'></div> <a href="scriptname.spt">Script</a> </div> </div> <div class="col-6"> <div class="caption">Табл. 1. Параметры водородных связей между остовными атомами во вторичной структуре.</div> <table class="table caption-top table-dark table-hover"> <thead> <tr> <th scope="col">Имена атомов</th> <th scope="col">Длина связи (Å)</th> <th scope="col">Угол N-H-O (град.)</th> </tr> </thead> <tbody> <tr> <thead><th scope="col" colspan="3" style="text-align:center">Alpha-Helix</th></thead> </tr> <tr> <td>O(163LYS) - N(167SER)</td> <td>2.87</td> <td>164.5</td> </tr> <tr> <td>O(164LEU) - N(168PHE)</td> <td>2.9</td> <td>152.5</td> </tr> <tr> <td>O(165VAL) - N(169LEU)</td> <td>3.01</td> <td>145.7</td> </tr> <tr> <thead><th scope="col" colspan="3" style="text-align:center">Beta-Sheet</th></thead> </tr> <tr> <td>O(92CYS) - N(83LEU)</td> <td>2.93</td> <td>161.5</td> </tr> <tr> <td>O(94HIS) - N(81CYS)</td> <td>3.05</td> <td>145.2</td> </tr> <tr> <td>O(81CYS) - N(94HIS)</td> <td>2.87</td> <td>146.6</td> </tr> </tbody> </table> </div> <div class="col-2"> </div> <section class="block_pr"> <h3 style="margin:0px">Результаты</h3> <p>По результатам измерений, среднее значение длины связи N-H-O составляет 2.927 Å (для альфа-спирали) и 2,95 Å (для бета-листа); средние значения углов соответственно равны 154.23 (для альфа-спирали) и 151.1 (для бета-листа) градусов.<br> Идеальное значение угла N-H-O составляет 180 градусов, то есть такая связь считается прочной; если угол отклоняется от 180 градусов, то связь ослабевает. То есть, градусная мера угла, лежащая в промежутке от 130 до 170 градусов, считается связью средней силы. По справочным данным, приемлемая длина связи[1] - 3.0 Å. Полученные данные находятся близко к теоретическому значению, а сама связь средней силы из-за средних значений угла N-H-O, оказавшихся больше 130 градусов, но меньше 180.</p> <h3>Литература:</h3> <ol> <li><a href="https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/(SICI)1097-0134(19990515)35:3%3C275::AID-PROT1%3E3.0.CO;2-V">High Precision Measurement of Hydrogen Bond Lengths in Proteins by Nuclear Magnetic Resonance Methods.</a></li> </ol> </section> </div> </div> </body> </html>