Лигандами В структуре 2B4L являются триметилглицин (сокращенно BET), и 1,2-этандиол (сокращенно EDO). Данные лиганды изображены на рисунке 1, зеленым показан BET, синим EDO.
Выбранный лиганд BET, показан на рисунке 1 зеленым цветом. Наиболее сильно взаимодействуют аминокислотные остатки Trp 178, Trp 72, Trp 225 - гидрофобные связи, и His 230, Gly 26, Ile 27 - водородные связи. Рисунок 3 показывает область белка, контактирующую с лигандом.
Схема приведенная ниже демонстрирует образование гидрофобных(обозначены розовым) и водородных связей(черным) За счет которых лиганд закреплен в белке.
