Вернуться на страницу семестров
Для этого практикума я выбрал белок с AC: Q3SXS7, под счастливым номером 7. Запустив Psi-blast, я провел в нем 3 поисковые интеграции, результаты которых предоставлены ниже в таблице.
Номер итерации Число находок выше порога (1е-7) Идентификатор худшей находки выше порога E-value этой находки Идентификатор лучшей находки ниже порога E-value этой находки
1 48 XP_001154286.1 7e-10 XP_003905674.1 3e-07
2 52 XP_004484190.1 2e-08 XP_004438315.1 3e-04
3 52 XP_003202364.1 2e-09 XP_005391208.1 5e-06
Получил последовательности белков, и выровнял их в T-Coffee и с помощью Blast, в папке CREDITS лежит этот проект. А ниже я представлю скрин из проекта с выравниваниями.

Из выравниваний видно, что прослеживается явная гомология между белками. Окрашивание CrustalX при 25% сходства.