Вернуться на страницу семестров

Филогенетическое дерево

     Задание 1. Базовые манипуляции с филогенетическими деревьями.

Пользуясь, филогенетическим деревом, представленным ниже, было нарисовано новое дерево с 7 рандомно выбранными организмами.

     1. Отобранные "счастливчики", 7 видов бактерий:

НазваниеМнемоника
Clostridium botulinumCLOB1
Clostridium tetaniCLOTE
Lactobacillus acidophilusLACAC
Streptococcus pneumoniae STRPN
Streptococcus pyogenesSTRP1
Bacillus anthracisBACAN
Bacillus subtilisBACSU

     2. Скобочная формула дерева

( (CLOB1,CLOTE), ( (BACAN,BACSU),(LACAC,(STRPN,STRP1)) ) ); *
* - программа MEGA прощает, если не поставить ; , однако правильно всё же ставить ;

     3. Изображение дерева

     4. Ветви дерева

Дерево содержит 4 нетривиальные ветки:

1) {CLOB1,CLOTE} против {BACAN,BACSU,LACAC,STRPN,STRP1}
2) {BACAN,BACSU} против {CLOB1,CLOTE,LACAC,STRPN,STRP1}
3) {LACAC,STRPN,STRP1} против {BACAN,BACSU,CLOB1,CLOTE}
4) {STRPN,STRP1} против {LACAC,BACAN,BACSU,CLOB1,CLOTE}