Классификация функций. Ферменты.

Расшифровка заданного кода фермента

3: hydrolases

4: Acting on peptide bonds (Peptidases)

11: Aminopeptidases

2: membrane alanyl aminopeptidase

Использование средства специализированного ресурса Brenda для характеристики фермента

Рисунок со схемой ферментативной реакции :

общее число ферментов с таким кодом:103

Ингибиторы:
1,10-Phenanthroline
2(S)-benzyl-3-[hydroxy(1'(R)-aminoethyl)phosphinyl]propanoyl-L-3-iodotyrosine
2(S)-benzyl-3-[hydroxy(1'(R)-aminoethyl)phosphinyl]propanoyl-L-3-iodotyrosine
2-[[(1-amino-3-methylbutyl)hydroxyphosphinyl]methyl]-4-methylpentanoic acid
2-[[(1-amino-4-phenylbutyl)hydroxyphosphinyl]methyl]-3-(4-hydroxymethyl)propionic acid
2-[[(1-amino-4-phenylbutyl)hydroxyphosphinyl]methyl]-3-phenylpropionic acid
2-[[(1-amino-4-phenylbutyl)hydroxyphosphinyl]methyl]-4-methylpentanoic acid
3-amino-2-tetralone derivatives
3-[(1-amino-3-methylbutyl)hydroxyphosphinyl]-propionic acid
Bestatin
Methicillin
Phenylalanine
Puromycin

Активаторы данного фермента не были найдены.

Оптимум PH различается для разных организмов но всегда находится в щелочной или изредка в очень слабо кислой области (6.75-9)

Сравнение ферментов с одинаковым кодом из эволюционно далеких организмов

AMPN_ECOLI:

PfamA	Peptidase_M1
13	383
PfamB	Pfam-B_39
396	520
PfamB	Pfam-B_1821
523	711
seg	Low Complexity
640	657
seg	Low Complexity
712	724
PfamB	Pfam-B_1876
725	869

AMPN_HUMAN :

signalp	Signal Peptide
1	33
tmhmm	Transmembrane (hidden)
9	31
seg	Low Complexity (hidden)
10	18
seg	Low Complexity
40	63
PfamA	Peptidase_M1
75	479
seg	Low Complexity (hidden)
372	376
PfamB	Pfam-B_39
492	570
PfamB	Pfam-B_287
580	648
PfamB	Pfam-B_112
649	732
PfamB	Pfam-B_541
747	808
PfamB	Pfam-B_123
812	965
seg	Low Complexity
859	868
ncoils	Coiled Coil
933	953

У этих белков найден только один общий домен - пептидаза М-1. Выравнивание было получен программой emma.

всё выравнивание домена

Во всём выравнивании заметны 2 сильно консервативных куска.