Тип макромолекулы - белковый фермент. Этот фермент является уридинофосфоролизой, относящейся к трансферазам и состоящей из 8, вероятно, идентичных субъединиц с молекулярной массой 22000. Данная для анализа структура 1TGV из PDB представляет собой фрагмент этой цепи в комплексе с 5-Fluorouridine и сульфатом. Структура состоит из двух идентичных цепей (A и B).
На рисунке 2 видно, что в структуре белка преобладают альфа-спирали.
Данная макромолекула относится к Escherichia coli. Цепь имеет следующий uniprot_id – P12758. Название — UPD_ECOLI. Данная цепь катализирует обратимое фосфорилирование уридина с образованием урацила и рибозо-1-фосфата. Кроме того, проявляет слабую активность в отношении дезоксиуридина и тимидина. Образующиеся молекулы, возможно, затем используются в качестве источника углерода и энергии или для восстановления пиримидиновых оснований для синтеза нуклеотидов. Относительно референса Uniport у цепи нет мутаций и нет модифицированных аминокислотных остатков.
Присутствует мутагенез последовательности в 5 позиции. Аспарагиновая кислота была заменена на аланин, глутаминовую кислоту или аспарагин [ссылка].
5-Fluoro-2'-deoxyuridine применялся в качестве субстрата для оценки фосфоролитической активности очищенного фермента [1].
В белке нет дисульфидных свзей, минимально расстояние между двумя серами 8,6 Å, что слишком много для образования связи.
