Практикум 11

Гомология и выравнивание

Для дальнейшей работы был выбран белковый домен с AC - PF00053 и Summary name - Laminin EGF domain.

Проект в Jalview

Таблица 1. Выравнивания
Раздел Информация Комментарии
Выравнивание seed Последовательностей - 72; Колонок - 72
Максимальный достоверный блок, включающие ВСЕ последовательности (МДБ-all) 38-51
100% консервативные колонки в МДБ-all 39:C; 48:C; 51:C
Максимальный достоверный блок, включающий НЕ ВСЕ последовательности. (МДБ-notAll)
Если есть другие максимальные блоки с тем же подмножеством последовательностей, то опишите их.
39-55
100% консервативные колонки в МДБ-notAll 39:С; 48:C; 49:D; 50:R; 51:C
Участок выравнивания, в котором нет никаких достоверных подблоков, и потому маловероятно, что выравнивание на этом участке отражает ход эволюции. 23-29 Не учитывать зеленую группу с гепами