Семейства белков. Pfam, Interpro

Доменная структура белка KPRS_BACSU по данным Pfam

Cхема из Pfam:
Пояснения к схеме
№	Pfam AC	Pfam ID	Полное название семейства доменов	Положение в последовательности белка KPRS_BACSU	Клан
1.	PF00156	Pribosyltran	Семейство доменов названо по названию ряд разнообразных фосфорибозил-ферментов трансферазы. Семейство включает в себя: аденин фосфорибозилтрансферазу, гипоксантин-гуанин-ксантин фосфорибозилтрансферазу, гипоксантин фосфорибозилтрансферазу, рибоза-фосфат пирофосфокиназу, амидофосфорибозилтрансферазу, оротат фосфорибозилтрансферазу, урацил фосфорибозилтрансферазу, ксантин-гуанин фосфорибозилтрансферазу. В N-конце этой области является АТФ-ГТФ-связывающим доменом.	153–254	Нет сведений о клане

Информация о домене

1) Домен входит в 49 различных архитектур.
2) Для 18859 белков, содержащих домен, известна последовательность.
3) Для 53 различных белков, содержащих домен, определена пространственная структура.
4) Выравнивание (изображение)
Выравнивание
Выравнивание подтверждает гомологичность доменов (участки 151-165).

Описание доменной архитектуры

Доменная архитектура белка Q9KY28_STRCO

Представленность домена DUF3706 и DUF2983 в организмах разных видов

Таким образом, данные домены присутствуют только в бактериях, что говорит об их малой распространенности.

Представленность изучаемых доменов в белках Bacillus subtilis

Таксономическое дерево домена из-за большого количества видов не открывается

Доменные перестройки

Домен PF12500 (DUF3706) не имеет характеристической функции





Домен PF01171 (ATP_bind_3) принадлежит надсемейству PP-loop





Домен PF00270 (DEAD) занимается различными аспектами метаболизма РНК, в том числе ядерной транскрипцией, предварительным сплайсингом, биогенезом рибосом, цитоплазматическим транспортом, переводом, распадом РНК и органелл, экспрессией генов