1)Найдено 3 мотива
2)Мотив 1, 3 встречаются во всех последовательностях, мотив 2 встречается во всех, кроме 1.
| Мотив | Последовательности | Координаты | P-value | Длина мотива | E-value |
| 1 |
KPRS_METS3 KPRS_METJA KPRS_PYRKO KPRS_SULSO KPRS_AERPE KPRS_THEVO KPRS1_ARCFU KPRS_PYRAE |
216-265 204-253 201-250 208-257 218-267 202-251 203-252 201-250 |
7.08e-45 1.21e-43 3.18e-43 3.18e-42 1.25e-40 1.37e-40 2.00e-40 1.31e-39 |
48 | 6.2e-077 |
| 2 |
KPRS_PYRAE KPRS_AERPE KPRS_METJA KPRS_PYRKO KPRS_METS3 KPRS_SULSO KPRS_THEVO |
67-107 81-121 71-111 68-108 70-110 72-112 70-110 |
7.88e-39 4.33e-37 5.60e-37 8.16e-37 9.25e-36 1.02e-35 1.00e-34 |
40 | 1.7e-056 |
| 3 |
KPRS_METS3 KPRS1_ARCFU KPRS_METJA KPRS_SULSO KPRS_PYRKO KPRS_THEVO KPRS_AERPE KPRS_PYRAE |
22-40 23-41 23-41 23-41 21-39 23-41 31-49 20-38 |
2.63e-18 1.43e-17 2.10e-17 2.38e-17 9.66e-17 1.33e-16 5.04e-16 5.24e-15 |
18 | 2.5e-023 |
Первый мотив, найденный MEME, при выравнивании программой muscle имеет большое число гэпов, что объясняется принципами работы программ: muscle - полное выравнивание, МЕМЕ - частичное. Выравнивания второго и третьего мотивов совпадают, т.е. программа muscle нашла мотивы, обнаруженные MEME.
Результат
1) Мотив 1 нашелся в 2 последовательностях из 25.
Мотив 2 нашелся только в 1 последовательности.
Мотив 3 не найден ни в одной из последовательностей.
2) Все мотивы не нашлись ни в одной из последовательностей.
3) Выравнивание, взятое из Pfam, соответствует мотивам.