| ID белка | AC белка | Число итераций | Для первой итерации | Для последней итерации | ||||
| Число находок выше порога (0,005) | Худшее E-value выше порога | Лучшее E-value ниже порога | Число находок выше порога (0,005) | Худшее E-value выше порога | Лучшее E-value ниже порога | |||
| P18196 | MINC_ECOLI | 5 | 162 | 0.005 | 0.006 | 882 | 0.002 | 0.38 |
| P0A832 | SSRP_ECOLI | 2 | 514 | 3e-10 | 5.6 | 1 | 5e-31 | 0.36 |
| P17265 | RP5M_RHIME | 3 | 14 | 0.001 | 0.005 | 25 | 9e-15 | 0.14 |
| P14193 | KPRS_BACSU | 5 | 183 | 4e-11 | 0.009 | 1857 | 5e-04 | 0.010 |
C ростом итерации растет и разрыв E-value: E-value лучших находок уменьшается, а худших - увеличивается. Для моего белка (последний в списке) не удалось стабилизировать список. Кроме того с каждой итерацией число находок увеличивается.
Для последовательности моего белка был изменен порог с 0,005 на 0,001. В результате список стабилизировался только на 7 интерации. Если пользоваться сервисом PSI-BLAST на EBI, где порог 0,001 стоит по умолчанию, то программа после первой интерации отказалась дальше работать из-за большого количества вариантов последовательностей. При уменьшении порога E-value требования ужесточаются, это позволяет отсеивать большее число последовательнотей. Таким образом список стабилизируется за меньшее число интераций.