Выравнивание последовательностей




Выравнивание последовательностей


результат

Процент идентичности: 71,43%
Процент сходства : 71,43%

Координаты (начало и конец) последовательности seq1 в полной последовательности моего белка KPRS_BACSU 

Query  199  RRPRPNVAEVMNIVGNIEGK  218  
            RRPRPNVAEVMNIVGNIEGK           
Sbjct  1    RRPRPNVAEVMNIVGNIEGK  20

Т.е. данная последовательность seq1 является фрагментом последовательности белка KPRS_BACSU на отрезке 199 - 218 а.о.

Выравнивание последовательностей моего белка KPRS_BACSU и белка KPRS_DESPS

1. Выравнивались белки из следующих организмов: KPRS_BACSU из Bacillus subtilis, KPRS_DESPS из Desulfotalea psychrophila.
2. Процент идентичности: 175/308 (57%)
Процент сходства : 231/308 (75%)
3. Число гэпов: 1/308 (0%)
4. Координаты выровненных участков: 10-316/5-312

Выравнивание последовательностей моего белка KPRS_BACSU и белка KPRS_DESPS в GeneDoc


результат

Первые части последовательностей примерно с 1 по 94 а.о. имеют мало общего, но начиная с 98 а.о. появляется много одинаковых частей.

© Alisa Garaeva