| Метка поля | Содержание | |
|---|---|---|
| Код(ы) доступа ("Accession number") | AC | P14193 |
| Идентификатор записи в БД | ID | KPRS_BACSU |
| Название (краткое описание) белка | DE | Ribose-phosphate pyrophosphokinase |
| Дата создания документа | DT | 01-JAN-199 |
| Дата последнего исправления аннотации | DT | 11-JAN-2011 |
| Число публикаций, использованных при создании документа | RN | 4 |
| Журнал и год самой поздней публикации | RL | Nat. Struct. Biol. 7:303-308(2000) |
| Ключевые слова | KW | 3D-structure(трехмерная структура); ATP-binding(связывание АТФ); Complete proteome(полный протеом); Cytoplasm(цитоплазма); Kinase(киназы); Magnesium(магний); Metal-binding(связывание металла); Nucleotide biosynthesis(биосинтез нуклеотидов); Nucleotide-binding(связывание нуклеотида); Transferase(трансфераза). |
| Что содержит поле комментариев? | CC | Описание каталитической деятельности, Информация о кофакторах, об участии в метаболических путях, субъединицах, внутриклеточном местоположении, сходствах с другими семействами, авторские права |
| Идентификаторы записей PDB | DR | 1DKU |
Является ли белок мембранным или цитоплазматическим?
Внутриклеточное местоположение: в цитоплазме, значит белок цитоплазматический
| Запрос | Число записей в SwissProt | Число записей в TrEMBL |
|---|---|---|
| Ribose-phosphate pyrophosphokinase | 211 | 2904 |
| pyrophosphokinase | 284 | 7195 |
| Ribose-phosphate | 237 | 3684 |
| Метка поля | Белок 1 | Белок 2 | |
|---|---|---|---|
| Первый код доступа | AC | P14193 | P65232 |
| Идентификатор последовательности в БД | ID | KPRS_BACSU | KPRS_MYCTU |
| Название (краткое описание) белка | DE | Ribose-phosphate pyrophosphokinase | Ribose-phosphate pyrophosphokinase |
| Дата создания документа | DT | 01-JAN-1990 | 11-OCT-2004 |
| Дата последнего исправления аннотации | DT | 11-JAN-2011 | 08-FEB-2011 |
| Название организма | OS | Bacillus subtilis | Mycobacterium tuberculosis |
| Классификация организма (список таксонов) | OC | Bacteria; Firmicutes; Bacillales; Bacillaceae; Bacillus | Bacteria; Actinobacteria; Actinobacteridae; Actinomycetales; Corynebacterineae; Mycobacteriaceae; Mycobacterium; Mycobacterium tuberculosis complex |
| Длина последовательности | SQ | 317 | 326 |
| Молекулярная масса белка | SQ | 34868 | 35477 |
| Число публикаций, использованных при создании | RN | 4 | 3 |
| Журнал и год самой поздней публикации | RL | Nat. Struct. Biol. 7:303-308(2000) | PLoS ONE 5:E8589-E8589(2010) |
| Описание вторичной структуры | FT |
CHAIN 1 317 REGION 217 230 METAL 134 134 METAL 136 136 METAL 145 145 METAL 149 149 STRAND 10 14 HELIX 19 29 STRAND 36 40 STRAND 46 50 STRAND 58 62 HELIX 69 85 STRAND 89 97 TURN 99 102 HELIX 114 125 STRAND 129 133 HELIX 138 143 STRAND 148 151 HELIX 154 163 STRAND 168 175 HELIX 179 189 STRAND 193 197 STRAND 210 213 STRAND 219 223 STRAND 225 229 HELIX 231 241 TURN 242 244 STRAND 246 251 STRAND 253 255 HELIX 261 266 STRAND 267 279 STRAND 288 293 HELIX 296 308 HELIX 313 316 |
CHAIN 1 326 REGION 223 236 METAL 136 136 METAL 138 138 METAL 147 147 METAL 151 151 CROSSLNK 29 29 |
| Ключевые слова | KW | 3D-structure(трехмерная структура); ATP-binding(связывание АТФ); Complete proteome(полный протеом); Cytoplasm(цитоплазма); Kinase(киназы); Magnesium(магний); Metal-binding(связывание металла); Nucleotide biosynthesis(биосинтез нуклеотидов); Nucleotide-binding(связывание нуклеотида); Transferase(трансфераза). | ATP-binding(связывание АТФ); Complete proteome(полный протеом); Cytoplasm(цитоплазма); Isopeptide bond(изопептидная связь); Kinase(киназы); Magnesium(магний); Metal-binding(связывание металла); Nucleotide biosynthesis(биосинтез нуклеотидов); Nucleotide-binding(связывание нуклеотида); Transferase(трансфераза); Ubl conjugation. |
| Темы, освещённые в комментариях | CC | Описание каталитической деятельности, информация о кофакторах, об участии в метаболических путях, субъединицах, внутриклеточном местоположении, сходствах с другими семействами, авторские права | Описание каталитической деятельности, информация о кофакторах, об участии в метаболических путях, внутриклеточном местоположении, сходствах с другими семействами, авторские права |
| Особенности последовательности | FT | Есть области связывания фосфорибозилпирофосфата, в состав последовательности входит магний, есть спирали, повороты | Есть области связывания фосфорибозилпирофосфата, в состав последовательности входит магний, изопептид (Lys-Gln), скован одной цепью с Q-Cter в белке Pup |
| Идентификаторы записей PDB | DR | 1DKU | - |
При сравнении этих двух белков обнураживается их большое сходство между собой. Например, похожи значения длины последовательности, молекулярной массы, наличие магния во вторичной структуре. Совпадают процессы каталитической деятельности, кофактор, участие в метаболических путях, внутриклеточное местоположение, сходство с другими семействами. Тем не менее, эти белки различаются строением вторичной структуры, они были найдены в разных организмах. Это все подтверждает большое разнообразие белков, которые несмотря на многие сходства, индивидуальны.