Исследование ДНК-белкового комплекса




Краткое описание структуры в файле 1A02.pdb

Для исследования были выбраны F и J цепи белка и цепи А и В, представляющие ДНК со следующей последовательностью:
Цепь А: [4002] TTGGAAAATTTGTTTCATAG [4020]
Цепь В: [4020] AACTATGAAACAAATTTTCC[4002]
где 4002 и 4020 - номера первого и последнего нуклеотидов.

Функции белка, структура которого представлена в файле dna.pdb

F цепь является фрагментом белка Proto-oncogene c-Fos. Это ядерный фосфопротеин, который образует плотный, но не ковалентно связанный комплекс с JUN/AP-1 (транскрипционным фактором). Играет важную роль в регулировании развития клеток, которые формируют и поддерживают скелет. Принимает участие в передаче сигнала, клеточной пролиферации и дифференцировке.

J цепь является фрагментом белка Transcription factor AP-1. Как видно из названия, он представляет собой транскрипционный фактор, который распознает и связывается с мотивом усилителя гептамера 5'-TGA [CG] TCA-3 '.Способствует деятельности NR5A1, когда фосфорилируется HIPK3, что приводит к увеличению стереогенетической экспрессии генов на cAMP сигнального пути стимуляции.

Характеристика ДНК-связывающего домена 1a02



© Alisa Garaeva