Классификация ферментов EC




Сбор информации о ферменте SPRE_HUMAN.

EC-код фермента Sepiapterin reductase 1.1.1.153.
1. - оксидоредуктаза
1.1. - действует на CH-OH группу доноров
1.1.1. - с NAD или NADP как акцептор
1.1.1.153 - Сепиаптерин редуктаза

Схема реакции, катализируемая ферментом:

 

(1) 7,8-dihydrobiopterin + NADP(+) = sepiapterin + NADPH. (2) Tetrahydrobiopterin + 2 NADP(+) = 6-pyruvoyl-5,6,7,8-tetrahydropterin + 2 NADPH.

Cохранение функции фермента у белков со сходными последовательностями.

Всего найдено 544 белка:
fasta
таблица

ЕС 1.1.*.*. - 18 находок.
ЕС 1.1.1.*. - 94 находки.
ЕС 1.1.1.153 - 1 находкa.

Поиск программой blastp с e-value=1.
Всего нашлось 10 белков.
Можно считать достоверным гомологом только SPRE_MOUSE, у которого полностью совпадает ЕС.
Название Фермент ЕС Идентичность
SPRE_MOUSE Sepiapterin reductase 1.1.1.153 64%
CBR2_MOUSE Carbonyl reductase [NADPH] 2 1.1.1.184 25%
DHB3_MOUSE Testosterone 17-beta-dehydrogenase 3 1.1.1.64 30%
DCXR_MOUSE L-xylulose reductase 1.1.1.10 24%
DRS7B_MOUSE Dehydrogenase/reductase SDR family member 7B 1.1.-.- 27%
DHRS4_MOUSE Dehydrogenase/reductase SDR family member 4 1.1.1.184 25%
HCD2_MOUSE 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase type-2 1.1.1.35 1.1.1.178 31%
DHB2_MOUSE Estradiol 17-beta-dehydrogenase 2 1.1.1.62 1.1.1.63 26%
PGDH_MOUSE 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)] 1.1.1.141 22%
DHRS1_MOUSE Dehydrogenase/reductase SDR family member 1 1.1.-.- 27%

Интересно, что у всех находок, кроме двух, сохрянается ЕС вплоть до подподкласса (3-ий знак), хотя процент идентичности достаточно маленький. Кроме того можно заключить, что редуктазы и дегидрогеназы сходны между собой по последовательностям.



© Alisa Garaeva