vkВконтакте
kodomoallakarpova@kodomo.fbb.msu.ru
GMailvseokeyboss@gmail.com
Учебный сайт
   Карповой Аллы
Киотская энциклопедия генов и геномов



Метаболический путь белка

Идентификатор моего фермента в базе данных KEGG - hsa:1371. В KEGG описан один метаболический путь моего фермента:

  1. hsa00860 - метаболизм порфирина и хлорофилла (Porphyrin and chlorophyll metabolism). Ссылка на графическое представление пути
метаболизм порфирина и хлорофилла

Рис.1. Метаболизм порфирина и хлорофилла.

Нахождение в KEGG структурных формул соединений

Если с главной страницы KEGG пройти по гиперссылке "KEGG2" ("KEGG Table of Contents"), а с открывшейся страницы – по гиперссылке "KEGG LIGAND", то можно выполнить поиск структуры любых соединений, если знать их английское название. Был осуществлен поиск структуры L-аспартата и глицина.

Идентификатор Русское название Английское название Структурная формула
C00049 L-аспартат L-aspartate, L-Aspartic acid
C00047 L-лизин L-Lysine, Lysine acid

Поиск метаболического пути от одного заданного вещества к другому

Если с главной страницы KEGG пройти по гиперссылке "KEGG PATHWAY", найти гиперссылку "Search&Color Pathway", то можно проследить метаболический путь от одного вещества к другому, я искала от L-аспартата до L-лизина.

Карта: биосинтез аминокислот.

Путь: L-аспартата --> L-лизина путь синтеза из L-аспартата L-лизина

Рис.2. Путь синтеза из L-аспартата L-лизина.

В таблице представлены названия и идентификаторы участников пути:

Идентификатор Название
C00049 L-аспартат
C03082 4-фосфо-L-аспартат
C00441 L-аспартат-4-семиальдегид
C20258 (2S,4S)-4-гидрокси-2,3,4,5-тетрагидродипиколинат
C03972 2,3,4,5-тетрагидродипиколинат
C00666 L,L-2,6-диаминогептановая кислота
C00680 Мезо-2,6-диаминогептановая кислота
C00047 L-лизин

© Алла Карпова

Дата последнего редактирования: 13.05.2014

Valid HTML 4.01 Transitional Правильный CSS!