Киотская энциклопедия генов и геномов
Метаболический путь белка
Идентификатор моего фермента в базе данных KEGG - hsa:1371. В KEGG описан один метаболический путь моего фермента:
- hsa00860 - метаболизм порфирина и хлорофилла (Porphyrin and chlorophyll metabolism). Ссылка на графическое представление пути
![метаболизм порфирина и хлорофилла](im/hsa00860.png)
Рис.1. Метаболизм порфирина и хлорофилла.
Нахождение в KEGG структурных формул соединений
Если с главной страницы KEGG пройти по гиперссылке "KEGG2" ("KEGG Table of Contents"), а с открывшейся страницы – по гиперссылке "KEGG LIGAND", то можно выполнить поиск структуры любых соединений, если знать их английское название. Был осуществлен поиск структуры L-аспартата и глицина.
Идентификатор | Русское название | Английское название | Структурная формула |
C00049 | L-аспартат | L-aspartate, L-Aspartic acid | ![]() |
C00047 | L-лизин | L-Lysine, Lysine acid | ![]() |
Поиск метаболического пути от одного заданного вещества к другому
Если с главной страницы KEGG пройти по гиперссылке "KEGG PATHWAY", найти гиперссылку "Search&Color Pathway", то можно проследить метаболический путь от одного вещества к другому, я искала от L-аспартата до L-лизина.Карта: биосинтез аминокислот.
Путь: L-аспартата --> L-лизина
Рис.2. Путь синтеза из L-аспартата L-лизина.
В таблице представлены названия и идентификаторы участников пути:
Идентификатор | Название |
C00049 | L-аспартат |
C03082 | 4-фосфо-L-аспартат |
C00441 | L-аспартат-4-семиальдегид |
C20258 | (2S,4S)-4-гидрокси-2,3,4,5-тетрагидродипиколинат |
C03972 | 2,3,4,5-тетрагидродипиколинат |
C00666 | L,L-2,6-диаминогептановая кислота |
C00680 | Мезо-2,6-диаминогептановая кислота |
C00047 | L-лизин |