Выравнивания E.coli (K12) и B.subtilis (168)

Глобальное выравнивание

Protein Name ID 1 ID 2 Score Identity(%) Similarity(%) Gaps Indels
Quinolinate synthase NADA_ECOLI NADA_BACSU 319.0 23.5 42.1 26.9 16
Nitrate/nitrite antiporter NarK NARK_ECOLI NARK_BACSU 385.0 23.4 39.9 25.3 19
Peroxide operon regulator PERR_ECOLI PERR_BACSU 24.5 7.5 14.7 72.3 10

Локальное выравнивание

Protein Name ID 1 ID 2 Score Identity(%) Similarity(%) Gaps Indels Coverage 1 Coverage 2
Quinolinate synthase NADA_ECOLI NADA_BACSU 329.0 25.8 46.2 20.9 13 89.34% 94.29%
Nitrate/nitrite antiporter NarK NARK_ECOLI NARK_BACSU 387.5 25.8 43.5 18.7 14 90% 93.17%
Peroxide operon regulator PERR_ECOLI PERR_BACSU 24.5 7.5 14.7 72.3 3 20.54% 54.48%

Глобальное и локальное выравнивания неродственных белков E.coli (K12) и B.subtilis (168)

Type of alignment Protein Name 1 Protein Name 2 ID 1 ID 2 Score Identity(%) Similarity(%) Gaps Indels Coverage 1 Coverage 2
Global CRISPR system Cascade subunit CasA Dihydroorotate dehydrogenase B (NAD(+)), electron transfer subunit CSE1_ECOLI PYRK_BACSU 29.5 9.1 16.2 66.8 15 - -
Local CRISPR system Cascade subunit CasA Dihydroorotate dehydrogenase B (NAD(+)), electron transfer subunit CSE1_ECOLI PYRK_BACSU 45.0 19.0 32.5 34.7 13 43% 91.8%

Исходя из полученных данных, можно предположить, что белки не гомологичны, так как показатели сходства и идентичности низкие, много гэпов и низкий вес выравнивания

Множественное выравнивание

Можно предположить, что все семь белков гомологичны, так как имеют множество консервативных участков Для этого задания я искал все белки, которые имеют мнемонику "NADA". Название белка Quinolinate synthase. Было найдено 328 белков. Выбраны NADA_ASPFU, NADA_PYRHO, NADA_THERO, NADO_ASPPU, NADO_THEMA. В>

Ссылка на окрашенное множественно выравнивание