Занятие 1. Работа в командной строке UNIX

C помощью команды: 

 infoseq sw:rs3_ecoli > rs3_ecoli.info

была получена информация о записи RS3_ECOLI банка SwissProt (файл rs3_ecoli.info)

C помощью команды: 

 infoseq -help 2> infoseq.help

была получена информация о программе "infoseq" (файл infoseq.help)

* все выше указанные файлы с результатами команд лежат в /home/students/y06/anahita/Term3/Practice1

С помощью команд Unix былы описано содержимое директории Term2:
ls -1 показывает содержимое текущей директории в алфавитном порядке (регистр первой буквы в названии файла имеет значение):

 1.txt
Credit_2
Credit_4
Pr_2-2
Practice1
Practice10
Practice11
Practice12
Practice2
Practice3
Practice8
Protocol
Test_BLASTP
classify.txt
i.txt
l.txt
r.txt
t.txt

ls -l вывод списка файлов с указанием директории, владельца,группы пользователей, размера, даты и имени: 
drwxr-xr-x 2 anahita Year-06 4096 May  3 20:41 Credit_2
drwxr-xr-x 2 anahita Year-06  138 May 18 14:27 Credit_4
drwxr-xr-x 2 anahita Year-06   40 Mar 16 17:06 Pr_2-2
drwxr-xr-x 3 anahita Year-06   41 Feb 16  2007 Practice1
drwxr-xr-x 2 anahita Year-06   51 May 20 00:45 Practice10
drwxr-xr-x 2 anahita Year-06   55 May 20 01:20 Practice11
drwxr-xr-x 2 anahita Year-06 4096 May 11 17:29 Practice12
drwxr-xr-x 2 anahita Year-06   57 Mar 23 01:55 Practice2
drwxr-xr-x 2 anahita Year-06   27 Apr  6 17:06 Practice3
drwxr-xr-x 2 anahita Year-06  124 May 20 00:42 Practice8
-rw-r--r-- 1 anahita Year-06   46 Mar 23 01:47 Protocol
drwxr-xr-x 2 anahita Year-06 4096 May 22 16:51 Test_BLASTP
-rw-r--r-- 1 anahita Year-06    0 Sep 10 23:08 l.txt

ls -t список файлов, сортированых по последним изменениям в них: 
t.txt
classify.txt
r.txt
l.txt
Test_BLASTP
Practice11
Practice10
Practice8
Credit_4
Practice12
Credit_2
Practice3
Practice2
Protocol
Pr_2-2
Practice1

ls -r список файлов, сортированных по алфавату, но в обратном порядке (на порядок также влияет регистр первой буквы в названии файла): 
r.txt
l.txt
Test_BLASTP
Protocol
Practice8
Practice3
Practice2
Practice12
Practice11
Practice10
Practice1
Pr_2-2
Credit_4
Credit_2

ls -i список файлов с указанием индексом каждого файла (i.txt) 
184555892 Credit_2
185294196 Credit_4
 59469757 Pr_2-2
111114405 Practice1
 75722371 Practice10
143259070 Practice11
102231449 Practice12
176310257 Practice2
218202424 Practice3
193696412 Practice8
100803525 Protocol
184574840 Test_BLASTP
100716111 classify.txt
101147510 i.txt
100725959 l.txt
100716110 r.txt
101117203 t.txt

ls --classify *2 - классификация поддиректорий содержащих в конце названия цифру 2. Поддиректории расположены в алфавитном порядке, файлы в них тоже располагаются в алфавитном порядке.(classify.txt) 
Credit_2:
1llu.fasta
1llu_.fasta
1uuf.fasta
1uuf_.fasta
Lisitsina.msf
Lisitsina.xls
Lisitsina_4
Lisitsina_cr2.doc
Lisitsina_matcher.msf
Lisitsina_matcher_fragments.msf
Lisitsina_stretcher.msf
Lisitsina_stretcher_fragments.msf

Pr_2-2:
Protocol*
prac22.fasta*

Practice12:
ADHC_MYCTU.fasta*
MTDH_FRAAN.fasta*
MTDH_PETCR.fasta*
chyhnya
do.emma
do_.fasta
domen.fasta*
emma -sequence domen.fasta -dendoutfile ddd.dnd -outseq mnv.fasta
emma domen.fasta do.fasta
phignya

Practice2:
P75691.txt*
Protocol
Protocol.doc*

на страницу III семестра

на главную