Выбранный мной организм - это байкальская нерпа или другое название - байкальский тюлень. Латинское название: Pusa sibirica. Это один из трёх пресноводных видов тюленя в мире, эндемик озера Байкал. Супер-милые животные , которые на закате солнца начинают массовое движение к островам, устраивая массовые лежбища , как на фото ниже.Из интересных фактов , удалось найти только о возможности нерп приостанавливать беременость(плод при этом не погибает, а впадает в анабиоз до следующего брачного периода) и что 26 мая отмечается день Нерпенка по всей России
Хромосом — 32—34.
Поисковый запрос:Pusa sibirica
Количество найденных сборок: 1
Уровень сборки: Chromosome(имеется последовательность для одной или нескольких хромосом. То есть, может быть полностью секвенированная хромосома без пробелов или хромосома, содержащая скаффолды или контиги с
пробелами между ними, также могут присутствовать неразмещенные или нелокализованные скаффолды)
Выбранная сборка: Reference(сборка генома отобрана вручную как точная/качественная, NCBI признали ее стандартной в сравнении с остальными сборками)
Задание 2.
Идентификатор GenBank
Идентификатор RefSeq
Общий размер генома
Scaffold N50
Scaffold L50
Contig N50
Contig L50
GCA_028975605.1
-
2,336Mb
151.5 Mb
7
14.3 kb
46,423
Таб 1. некоторые характеристики выбранной сборки
Contig N50 = 151.5 Mb-длина, для которого 50% всех нуклеотидов сборки содежится в контигах такой и большей длины
Contig L50 = 7: Наименьшее число контигов, в которых содержится 50% всех нуклеотидов сборки
Потакой же аналогии и Scaffold
Задание 3.
Cкачала файл
Нуклеотидные последовательности генома (в формате FASTA)
