Краткое описание генома вируса Rubella virus

Rubella virus — вирус семейства Togaviridae. Сферические вирусные частицы диаметром 50-70 нм покрыты липидной мембраной. Есть выступающие "шипы" длиной 6 нм, состоящие из вирусных белков Е1 и Е2, погруженных в мембрану. Под липидной мембраной расположен капсид. Геном представляет собой одноцепочечную РНК из 9762 нуклеотидов [1]. Вирус проникает в организм человека, вызывая острое инфекционное заболевание — краснуху. Только люди болеют краснухой [2]. Различают приобретенную краснуху (передающуюся от больного человека здоровому воздушно-капельным путем) и врожденную (передающуюся от матери к плоду). Симптомами краснухи являются мелкопятнистая кожная сыпь, увеличение затылочных и задне-шейных лимфоузлов, умеренная общая интоксикация [3]. Краснуха, как правило, легко переносится и не вызывает серьезных осложнений. Переболев ею, человек приобретает иммунитет. Специального лечения против краснухи нет, можно предотвратить болезнь с помощью вакцины. Но краснуха опасна, если женщина заразится ею в первом триместре беременности, т.к. мать с вероятностью 90% передаст вирус плоду. Это может привести к выкидышу, мертворождению или тяжелым врожденным порокам развития, известным как синдром врожденной краснухи (СВК) [3]. [4].

В таблице 1 привдены основные параметры генома вируса Rubella.

Таблица 1. Основные параметры генома вируса

Параметр Значение
Латинское название вируса Rubella virus
Русское название вируса Вирус краснухи
Количество фрагментов в полном геноме 1
Общая длина генома (п.н.) 9762
Количество кодируемых в геноме белков 2

Последовательность самого короткого белка Rubella virus 

>NP_062884.1 structural polyprotein
MASTTPITMEDLQKALEAQSRALRAELAAGASQSRRPRPPRQRDSSTSGDDSGRDSGGPR
RRRGNRGRGQRRDWSRAPPPPEERQETRSQTPAPKPSRAPPQQPQPPRMQTGRGGSAPRP
ELGPPTNPFQAAVARGLRPPLHDPDTEAPTEACVTSWLWSEGEGAVFYRVDLHFTNLGTP
PLDEDGRWDPALMYNPCGPEPPAHVVRAYNQPAGDVRGVWGKGERTYAEQDFRVGGTRWH
RLLRMPVRGLDGDSAPLPPHTTERIETRSARHPWRIRFGAPQAFLAGLLLATVAVGTARA
GLQPRADMAAPPTLPQPPCAHGQHYGHHHHQLPFLGHDGHHGGTLRVGQHYRNASDVLPG
HWLQGGWGCYNLSDWHQGTHVCHTKHMDFWCVEHDRPPPATPTPLTTAANSTTAATPATA
PAPCHAGLNDSCGGFLSGCGPMRLRHGADTRCGRLICGLSTTAQYPPTRFGCAMRWGLPP
WELVVLTARPEDGWTCRGVPAHPGARCPELVSPMGRATCSPASALWLATANALSLDHALA
AFVLLVPWVLIFMVCRRACRRRGAAAALTAVVLQGYNPPAYGEEAFTYLCTAPGCATQAP
VPVRLAGVRFESKIVDGGCFAPWDLEATGACICEIPTDVSCEGLGAWVPAAPCARIWNGT
QRACTFWAVNAYSSGGYAQLASYFNPGGSYYKQYHPTACEVEPAFGHSDAACWGFPTDTV
MSVFALASYVQHPHKTVRVKFHTETRTVWQLSVAGVSCNVTTEHPFCNTPHGQLEVQVPP
DPGDLVEYIMNYTGNQQSRWGLGSPNCHGPDWASPVCQRHSPDCSRLVGATPERPRLRLV
DADDPLLRTAPGPGEVWVTPVIGSQARKCGLHIRAGPYGHATVEMPEWIHAHTTSDPWHP
PGPLGLKFKTVRPVALPRTLAPPRNVRVTGCYQCGTPALVEGLAPGGGNCHLTVNGEDLG
AVPPGKFVTAALLNTPPPYQVSCGGESDRATARVIDPAAQSFTGVVYGTHTTAVSETRQT
WAEWAAAHWWQLTLGAICALPLAGLLACCAKCLYYLRGAIAPR

Источники:
[1] Wikipedia.org Rubella virus
[2] Wikipedia.org Rubella
[3] Пудилова Э. В. МЕХАНИЗМЫ ПЕРЕДАЧИ ВИРУСА КРАСНУХИ И ЕГО ВЛИЯНИЕ НА ЭМБРИОН ЧЕЛОВЕКА. Успехи современного естествознания № 8 / 2011
[4] ВОЗ Информационный бюллетень N°366 Ноябрь 2014 г.