Описание белка NP_228195.1 из генома Thermotoga maritima MSB8 и его геномного окружения

Белок NP_228195.1 – aнаэробная рибонуклеозид трифосфат редуктаза – фермент класса оксидоредуктаз, катализирует восстановление нуклеозид 5'-трифосфатов до 2'-диоксинуклеозид 5'-трифосфатов.

Последовательность белка в FASTA-формате

>NP_228195.1 Thermotoga maritima MSB8 anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase
MKVQYSFEREFEELMSDLLSKYGYEMFQMDGLGDQLDVVKFTEDFVRRGIIESTIDANAN
VRVTNISTYFIEISKPHTYLYSLYRIWQKMKEMFGKGVADEFVEAQINGAVYLHDRHHAA
LMPYCFAYTLKPIVEKGLPFIKTIKSEPAKHLSTFIQHVIQFVMFASNQSSGAVGLPDFF
VWMWYFVKKDLKEGIIPRDKLDWYIEQHFQILTYSLNQPIRTTQSPYTNFTYLDRNYIKA
IFEGERYPDGSLITDHVEDIIALQKHYWEWVSRERERQMFTFPVLTASLLYKDGKFLDED
SARFINKINMKWQDTNWYISDSIDAVASCCRLTSSTQTLKKFSLSSEEEEKLKGRMNSIG
GSDLNIGSFKVITVNLPRIALESGGDREKYLQILRHRVQLIKKALAAVREIIKERISEGL
LPLYENGLMLLNRQYGTIGVTGVWESASIMGLTTEDIDGLKYTEEGEVFVDNVLDTIREE
AEKGYHEYGFTFNIEQVPAEKAAVTLAQKDRFLFGEKQPFEIYSNQWVPLMANTDVLNRI
RYSGKWDKKVSGGAILHINLGESFKTEEESFNMVKMIADMGVMYFAFNTKISVCEDGHAF
YGERCPVCGKAKVDEYMRIVGYLVPVSAFNKERREIEYPRRQFYDSLTIRR

В геноме Thermotoga maritima MSB8 aнаэробная рибонуклеозид трифосфат редуктаза кодируется на прямой цепи, геном, который имеет координаты 403211..405166. То есть белок кодируется 1956 нуклеотидами, а его длина составляет 652 аминокислотных остатка (см. таблица 1).

Таблица 1. Описание анаэробной рибонуклеозид трифосфат редуктазы
из генома бактерии Thermotoga maritima MSB8
Параметр Значение
Идентификатор белка NP_228195.1
Идентификатор GI 15643151
Идентификатор генома NC_000853
Координаты гена в геноме 403211..405166
Длина гена (в парах нуклеотидов) 1956
Цепь Прямая
Длина белка 651 аминокислотный остаток

На рисунке 2 представлено геномное окружение белка NP_228195.1 в геноме Thermotoga maritima MSB8

Рисунок 2. Изображение геномного окружения белка