Филогенетические деревья
Список бактерий
| Отобранные бактерии |
| Название |
Мнемоника |
| Bacillus anthracis |
BACAN |
| Bacillus subtilis |
BACSU |
| Clostridium botulinum |
CLOBA |
| Finegoldia magna |
FINM2 |
| Lactobacillus acidophilus |
LACAC |
| Listeria monocytogenes serovar 1/2a |
LISMO |
| Staphylococcus aureus |
STAAR |
| Streptococcus pyogenes serotype M1 |
STRP1 |
Скобочная формула дерева
((CLOBA, FINM2), ((LACAC, STRP1), (((BACAN, BACSU), LISMO), STAAR)));
Изображение дерева
Нетривиальные ветви
- {CLOBA, FINM2} против {LACAC, STRP1, BACAN, BACSU, LISMO, STAAR}
- {LACAC, STRP1} против {CLOBA, FINM2, BACAN, BACSU, LISMO, STAAR}
- {BACAN, BACSU} против {LISMO, STAAR, CLOBA, FINM2, LACAC, STRP1}
- {BACAN, BACSU, LISMO} против {STAAR, CLOBA, FINM2, LACAC, STRP1}
- {BACAN, BACSU, LISMO, STAAR} против {CLOBA, FINM2, LACAC, STRP1}
Расширенная таблица с классификацией согласно NCBI Taxonomy
| Отобранные бактерии |
| Название |
Мнемоника |
Таксон |
| phylum |
class |
order |
family |
genus |
species group |
| Bacillus anthracis |
BACAN |
Firmicutes |
Bacilli |
Bacillales |
Bacillaceae |
Bacillus |
Bacillus cereus group |
| Bacillus subtilis |
BACSU |
Firmicutes |
Bacilli |
Bacillales |
Bacillaceae |
Bacillus |
Bacillus subtilis group |
| Clostridium botulinum |
CLOBA |
Firmicutes; |
Clostridia; |
Clostridiales; |
Clostridiaceae; |
Clostridium |
|
| Finegoldia magna |
FINM2 |
Firmicutes; |
Tissierellia; |
Tissierellales; |
Peptoniphilaceae; |
Finegoldia |
|
| Lactobacillus acidophilus |
LACAC |
Firmicutes; |
Bacilli; |
Lactobacillales; |
Lactobacillaceae; |
Lactobacillus |
|
| Listeria monocytogenes serovar 1/2a |
LISMO |
Firmicutes; |
Bacilli; |
Bacillales; |
Listeriaceae; |
Listeria |
|
| Staphylococcus aureus |
STAAR |
Firmicutes; |
Bacilli; |
Bacillales; |
Staphylococcaceae; |
Staphylococcus |
|
| Streptococcus pyogenes serotype M1 |
STRP1 |
Firmicutes; |
Bacilli; |
Lactobacillales; |
Streptococcaceae; |
Streptococcus; |
Streptococcus pyogenes |
- Нетривиальная ветвь {LACAC, STRP1, BACAN, BACSU, LISMO, STAAR} выдеяет класс Bacilli
- Нетривиальная ветвь {BACAN, BACSU, LISMO, STAAR} выдеяет порядок Bacillales
- Нетривиальная ветвь {LACAC, STRP1} выделяет порядок Lactobacillales
- Нетривиальная ветвь {BACAN, BACSU} выделяет семейство Bacillaceae род Bacillus
