Частоты остатков в протеомах

Для исследования использовались следующие протеомы: Escherichia coli (штамма K12), идентификатор UP000000625, число последовательностей 4306, число остатков 1356195 (включая U). Streptomyces avermitilis MA-4680 = NBRC 14893, идентификатор UP000000428, число последовательностей 7672, число остатков 2610487.

табл.1 Остатки в протеомах, %

остаток	% в протеоме S. avermitilis	% в протеоме E. coli	% разности
A	13,44%	9,51%	3,93%
C	0,81%	1,16%	0,35%
D	5,94%	5,15%	0,79%
E	5,61%	5,76%	0,16%
F	2,73%	3,89%	1,16%
G	9,49%	7,37%	2,11%
H	2,35%	2,27%	0,08%
I	3,14%	6,01%	2,87%
K	2,30%	4,41%	2,10%
L	10,22%	10,67%	0,45%
M	1,72%	2,82%	1,10%
N	1,81%	3,95%	2,14%
P	6,10%	4,43%	1,67%
Q	2,85%	4,44%	1,59%
R	8,00%	5,51%	2,48%
S	5,26%	5,80%	0,54%
T	6,24%	5,40%	0,84%
V	8,35%	7,07%	1,27%
W	1,54%	1,53%	0,01%
Y	2,12%	2,85%	0,73%

У E. coli наиболее часто встречаются остатки A, L, G, а у S. avermitilis - те же. Реже всего у E. coli встречаются C, W, H, а у S. avermitilis - C, W, M. При этом остаток A встречается у avermitiles чаще, чем у coli, и разница составляет 3,93%. А вот остаток I чаще встречается у coli с разницей в 2,87%.