Параметры водородных связей между остовными атомами во вторичной структуре |
| # | Имена атомов | Длина связи (A) | Угол N-O-C (°) |
| Альфа-спирали |
| 1 | [GLN]65:B.N #2936 - [ALA]61:B.O #2916 | 2.77 | 153.5 |
| 2 | [MET]59:B.N #2900 - [THR]55:B.O #2875 | 3.15 | 166.8 |
| 3 | [ALA]57:B.O #2889 - [ALA]61:B.N #2913 | 2.92 | 151.1 |
| Бета-тяжи |
| 4 | [CYS]335:A.O #2431 - [VAL]187:A.N #1318 | 2.86 | 170.1 |
| 5 | [CYS]335:A.N #2428 - [VAL]187:A.O #1321 | 3.05 | 158.7 |
| 6 | [TRP]333:A.N #2408 - [VAL]189:A.O #1335 | 2.92 | 146.5 |
Характерная длина водородных связей составляет 2,8 - 3,1 А. Угол N-O-C (°) обычно изменяется в диапазоне 146 -170 (°).